企业所申报的领域，不属于《国家重点支持的高新技术领域》范围内或领域选择错误。

认定前一年内发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。

1、未按照要求建立研发费用辅助账 。

2、研发费用不真实、不合理，比如：研发项目均为产品产业化项目，前期研发投入小，后期产业化投入大，但是申报书中大部分项目均是当年研发投入比例大；研发项目的文字资料未能体现项目的创新性，不被认为是研发创新活动，专家对此类研发费用归集的合理性存疑，剔除后研发费用占比不够。

1、有产品为贸易收入，剔除后占比不够。

2、有产品技术含量低，为简单的加工包装产品，不符合领域支持，剔除后导致高新占比不够。

3、产品归集收入范围大，高新收入应该是发票的一部分，企业在归集后将全部金额计入，剔除后导致高新占比不够。

4、产品的证明材料不足，检测报告不能支撑产品的技术性、创新性，不被专家认可，剔除后导致高新占比不够。

企业知识产权数量有限，高新收入归集存在问题等原因，造成主要产品收入不足高新收入的50%，不符合必要的申报条件。

科技人员中有生产工人、市场、销售人员，剔除后人员占比不够。

科技成果转化的资料不足，或转化本身不合理，导致专家不认可，有效转化数低于预期。

不能根据企业的实际情况制定制度文件，全部为网上模板，实际得分1-2分，极大降低了高企总分。

1、  有的企业提供的是增值税纳税申报表，有的提供的是企业所得税季报申报表。

2、因压缩技术不佳，上传资料存在缺漏。

1、年度审计报告中注册会计师出具审计意见为“保留意见”；

2、企业自行修改纳税申报表，存在作假问题。